新企業(yè)所得稅納稅申報主表以會計核算為基礎(chǔ)，以稅法規(guī)定為標準進行間接納稅調(diào)整，即在利潤總額的基礎(chǔ)上通過納稅調(diào)整，確定年度應稅所得額。因反映在利潤總額中的投資收益并不等于企業(yè)所得稅法所規(guī)定的權(quán)益性投資收益，按權(quán)益法核算的長期股權(quán)投資收益和稅法上確認的投資收益不一致，所以在計算應稅所得額時，應對權(quán)益法下核算的長期股權(quán)投資收益進行納稅調(diào)整。

　　一、權(quán)益法下長期股權(quán)投資對初始投資成本調(diào)整確認收益的調(diào)整

　　權(quán)益法核算下企業(yè)取得的長期股權(quán)投資，初始投資成本小于取得投資時應享有的被投資單位可辨認凈資產(chǎn)公允價值份額的，應對長期股權(quán)投資賬面價值進行調(diào)整，計入取得投資當期的損益。而企業(yè)所得稅法規(guī)定企業(yè)對外進行權(quán)益性投資，通過支付現(xiàn)金取得的投資資產(chǎn)，以購買價為成本；通過支付現(xiàn)金以外的方式取得的投資資產(chǎn)，以該項資產(chǎn)的公允價值和支付的相關(guān)稅費為成本；初始投資成本小于被投資單位凈資產(chǎn)公允價值的部分不計入計稅所得額，計算所得稅時應作納稅調(diào)整調(diào)減項目處理。

　　[例1]甲企業(yè)于2007年1月取得對乙公司40%的股權(quán)，支付價款1500萬元，取得被投資單位凈資產(chǎn)公允價值4000萬元；甲企業(yè)對該項投資采用權(quán)益法核算；長期股權(quán)投資的初始成本1500萬元小于取得投資時應享有被投資單位可辨認的凈資產(chǎn)公允價值1600萬，差額100萬元在會計核算作為營業(yè)外收入處理，計算應納所得稅時，納稅調(diào)整減少金額100萬元。

　　二、權(quán)益法下長期股權(quán)投資持有期間投資損益的調(diào)整

　　企業(yè)取得長期股權(quán)投資后，采用權(quán)益法核算的，應按照應享有或應分擔被投資單位實現(xiàn)的凈利潤或發(fā)生的凈虧損份額，調(diào)整長期股權(quán)投資的賬面價值，并確認為當期損益。而在計算所得稅時，這部分投資收益并不計入應稅所得額；被投資單位發(fā)生的損失，按稅法規(guī)定由被投資單位進行彌補，投資單位不得將權(quán)益法下確認的投資損失在所得稅前扣除，因此需要做納稅調(diào)整處理。

　　[例2]A公司2006年12月取得B公司40%的股權(quán)，采用權(quán)益法核算；B公司2007年實現(xiàn)凈利潤3000萬元；A公司按持股比例應享有被投資單位的凈利潤1200萬元，在會計核算上作為貸記投資收益處理，增加當期利潤總額；但是該項投資收益按稅法規(guī)定不計入應稅所得納稅，因此計算納稅時應調(diào)減應稅所得額1200萬元；如果B公司2007年虧損3000萬元，企業(yè)在會計核算上已作借記投資收益處理，減少當期利潤總額，因該項投資損失不能在稅前扣除，故納稅調(diào)增增加額1200萬元。

　　三、權(quán)益法下投資企業(yè)從被投資單位分得現(xiàn)金股利或利潤的調(diào)整

　　按照權(quán)益法核算的長期股權(quán)投資，投資企業(yè)從被投資單位取得的現(xiàn)金股利或利潤，在會計核算上應區(qū)別不同情況進行處理：投資企業(yè)從被投資單位分得的現(xiàn)金股利或利潤未超過已確認投資收益的，在會計核算上作借記應收股利，貸記長期股權(quán)投資——損益調(diào)整處理，不計入當期損益；投資企業(yè)從被投資單位取得的現(xiàn)金股利或利潤超過已確認投資收益部分，但未超過投資以后被投資單位實現(xiàn)的賬面凈利潤中應享有的份額，應作為投資收益處理；自被投資單位取得的現(xiàn)金股利或利潤超過已確認的投資收益，同時也超過了投資后被投資單位實現(xiàn)的賬面凈利潤中按持股比例應享有的那部分，作為投資成本收回，沖減長期股權(quán)投資——損益調(diào)整、投資成本等。無論哪種情況，在計算企業(yè)所得稅時，都應將在會計核算上不作投資收益處理的應收股利或利潤作納稅調(diào)整增加額處理。

　　[例3]2007年1月甲公司取得乙公司40%的股份，按照權(quán)益法核算長期股權(quán)投資；2007年乙公司實現(xiàn)凈利潤4000萬元，年初未分配利潤為貸方2000萬元，2007年度分配利潤3000萬元；甲企業(yè)應收股利或利潤1200萬元因在會計核算上沒有計入投資收益或利潤總額，所以在計算所得稅時納稅調(diào)整增加金額1200萬元；如果2007年被投資單位分配利潤5000萬元，甲企業(yè)應分得的利潤2000萬元，超出已確認的投資收益1600萬元，但未超過自投資后被投資單位實現(xiàn)的賬面利潤中本企業(yè)應享有的份額。甲公司應分得的利潤超出投資收益部分400萬元已作投資收益處理，因此納稅調(diào)增金額是1600萬元。

　　四、企業(yè)轉(zhuǎn)讓長期股權(quán)投資取得投資損益的納稅調(diào)整

　　企業(yè)轉(zhuǎn)讓長期股權(quán)投資取得的收益或損失，應計入當期損益處理。由于稅法與會計準則對投資成本認定的標準不同，因此在轉(zhuǎn)讓長期股權(quán)投資時，按照稅法規(guī)定確認的股權(quán)投資轉(zhuǎn)讓收益或損失與按照會計準則確認的轉(zhuǎn)讓股權(quán)收益或損失存在一定差異，這種差異實質(zhì)上就是長期股權(quán)投資的賬面價值與計稅基礎(chǔ)之間的差異，企業(yè)在申報所得稅時應對股權(quán)投資轉(zhuǎn)讓損益進行納稅調(diào)整。

　　[例4]A公司2006年12月以現(xiàn)金資產(chǎn)6000萬元取得B公司40%的股份，并采用權(quán)益法核算；A公司2006年12月31日長期股權(quán)投資面價值6000萬元，2007年度B公司實現(xiàn)凈利潤2000萬元，A公司按持股比例應享有B公司實現(xiàn)凈利潤部分800萬元已按規(guī)定做投資收益處理，并調(diào)整了2007年長期股權(quán)投資賬面價值2008年2月A公司將持有B公司40%的股份全部轉(zhuǎn)讓，取得收入7000萬元。轉(zhuǎn)讓股權(quán)時A公司股權(quán)投資賬面價值6800萬元，股權(quán)投資計稅基礎(chǔ)600037元；應計入當期損益的股權(quán)投資轉(zhuǎn)讓收益200萬元，而計人當期應稅所得的股權(quán)投資轉(zhuǎn)讓收益是1000萬元；按稅法確認的收益與會計上確認的收益相差80037元（股權(quán)投資計稅成本與股權(quán)投資賬面價值的差異），應作納稅調(diào)增項目增加額800萬元。如果B公司2007年虧損2000萬元，則A公司在會計核算上確認投資損失800萬元；A公司股權(quán)投資賬面價值是5200萬元，股權(quán)投資計稅基礎(chǔ)6000萬元；會計上確認的投資轉(zhuǎn)讓收益1800萬元，稅法上確認的投資轉(zhuǎn)讓所得1000萬元，納稅調(diào)整減少額800萬元。